中大团队借助人工智能技术发现大量全新RNA病毒
10月9日,中大智中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》(Cell)杂志发表论文,团队报告了全球范围的借助技术AG超玩会180个超群、16万余种的人工RNA病毒发现,大幅扩展全球RNA病毒的发现多样性。该研究将人工智能技术应用于病毒鉴定,大量毒发现了传统研究方法未能发现的全新病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的中大智新路径。
论文发表在《细胞》(Cell)杂志上。借助技术
传统的人工病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,发现面对RNA病毒这种高度分化、大量毒AG超玩会种类繁多且容易变异的全新病毒识别效率低。在该研究中,中大智团队开发的LucaProt人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序列深度学习,并在数据集中自主判断病毒序列。利用这套算法,研究团队在来自全球生物环境样本的10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。
使用人工智能对全球病毒圈深度挖掘并分类。
“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒,这种能力在疾病防控和新病原的快速识别中尤为重要。特别是在疫情暴发时,人工智能的速度和精度可以帮助科学家更快地锁定潜在病原体。”施莽说。
通过进一步分析,团队报告了迄今最长的RNA病毒基因组,长度达到47250个核苷酸;发现了超出以往认知的基因组结构,展现出RNA病毒基因组进化的灵活性;识别到多种病毒功能蛋白,特别是与细菌相关的功能蛋白,进一步表明还有更多类型的RNA噬菌体亟待探索;发现在南极底泥、深海热泉、活性污泥和盐碱滩等极端环境中,RNA病毒的数量和多样性仍然较高。新病毒的发现,刷新着科学家对病毒圈的认识。
文章第一作者侯新(左三)和阿里云团队在中山大学医学院合影。
“面对远源的新病毒,现有的病毒分类体系已经显得力不从心。未来,这一体系在门、纲等更深层次的分类上,可能会有大规模的调整。”施莽说,“我们的研究展示了病毒多样性的深度,但广度仍有待更多样本的补充。病毒的多样性远超人类想象,我们目前所看到的仍是冰山一角。”
施莽表示,这项研究与阿里云飞天实验室的AI4S-生物计算团队合作开展,希望未来继续通过跨领域科研合作,充分利用云计算和人工智能的优势,解决生命科学领域的重要问题。
南方网、粤学习记者 刘单燕
通讯员 朱嘉豪 李建平
- ·提前70天!西江航运干线长洲枢纽船闸货物通过量突破1.83亿吨
- ·市运会乒乓球赛事今日收拍,梅江区揽14金8银10铜!
- ·追回欠薪423万!梅州法院根治欠薪夏季专项行动取得阶段性成效
- ·梅州综保区完成进出区业务全流程测试
- ·广州大学食堂被曝售卖过期食品,市场监管部门:将严肃处理
- ·投它!“梅州十景”“梅州文十景”“梅州十四大名人故(旧、祖)居”投票启动啦
- ·梅州经济半年报丨进出口比增25%顺差扩大8.8%,机电产品、陶瓷产品、家具等主要出口商品出口均正增长
- ·客家盼“双杀”支云!15日晚,中甲联赛梅州赛区将上演焦点战
- ·全网销量第一?都是带货话术!广州市场监管部门最新提醒
- ·消防“神器”!3360个智慧烟感报警器“入驻”梅城老旧公房
- ·今天,父母“隔空”为在东京奥运会的女儿陈清晨打气!来看梅州日报专访陈父母...
- ·梅州三地区拟入选!“广东省民间文化艺术之乡”候选名单公示
- ·中山古镇:到苏炳添他乡看“村落BA”,来一场说走就走的美食之旅
- ·雨情快报!过去24小时,最大雨量出现在平远!未来几天...
- ·30多家企业先后签约人民币外汇衍生品业务!梅州涉外企业汇率避险意识明显提高
- ·助力梅州电商扶贫!梅州市梅江区农村电商培训和就业创业基地今日挂牌
- ·省“整治违法排污企业保障群众健康”环保行动专项督查组到石棉县督查
- ·护路人“技能满分”! 他们,用心用力守护群众平安出行路
- ·梅州妹子陈清晨晋级决赛!向奥运会羽毛球女双冠军发起冲击
- ·@梅州人 想知道您是不是密切接触者?戳进来一查便知!
- ·广州多家银行接到通知:房贷商贷利率不得低于公积金贷款利率
- ·今天,父母“隔空”为在东京奥运会的女儿陈清晨打气!来看梅州日报专访陈父母...
- ·免费为退役军人开展技能培训!这个培训班陆续开班啦~
- ·梅州A股上市公司股票一周盘点丨梅州公司股价整体波动较大,紫晶存储涨幅振幅最大交易最活跃
- ·林若熹师生作品开展幕
- ·@所有人,“网上车管所”超便捷!足不出户就能自助办理车管业务~